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16S核糖体DNA高通量测序研究种植体龈沟液微生物的变化
高通量测序 种植体周围炎 微生物多样性
2020/7/1
应用16S核糖体DNA(rDNA)高通量测序技术研究健康天然牙、健康种植体以及种植体周围炎的植体龈沟液内微生物菌群的差异,为理解种植体周围组织从健康至疾病状态的病因提供依据。方法 通过Illumina HiSeq 2500测序技术,分析30个龈沟液细菌的菌群结构及多样性。
法医微生物是目前法医学研究的前沿热点之一。16S rRNA基因由于其保守性与特异性并存的特点,是法医学鉴定的理想标记。伴随着高通量测序技术的快速发展,对微生物的研究已逐步应用于环境、医疗等多个领域。在法医学领域,以16S rRNA基因测序为代表的法医微生物研究成果也逐步应用于法医学实践中的生物检材鉴定、个体识别、死亡时间推断、地域推断等方面,为案件的侦查提供线索,为传统方法作为补充和辅助。本文阐述...
肺炎克雷伯菌16S rRNA甲基化酶耐药基因研究
16S rRNA甲基化酶 聚合酶链反应 抗药性 微生物
2014/9/11
了解肺炎克雷伯菌对氨基糖苷类抗生素的敏感性及16S rRNA甲基化酶检出情况。方法收集中南大学湘雅医院2009年1—7月非重复肺炎克雷伯菌96株,采用琼脂稀释法对庆大霉素、阿米卡星、妥布霉素的最低抑菌浓度(MIC)进行检测;聚合酶链反应(PCR)扩增16S rRNA甲基化酶基因armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD和npmA。结果肺炎克雷伯菌对阿米卡星、庆大霉素及妥布霉素的MIC50分别...
16S rDNA测序在呼吸机相关性肺炎痰液细菌多样性分析中的应用
呼吸机相关性肺炎 痰液 细菌培养
2014/10/17
用 16S?rDNA 测序研究呼吸机相关性肺炎 ( VAP)患者痰液中致病菌的种类和丰度,探讨VAP 病原学诊断的新方法。 方法 对 31 例 VAP 患者进行支气管肺泡灌洗,提取痰液标本细菌 DNA,进行聚合酶链反应 ( PCR)鉴定,同时进行痰液细菌培养。利用 16S?rDNA 测序技术进行宏基因测序及生物信息学分析,并将测序结果与细菌培养结果比较。
建立创伤弧菌基因分型的新方法,了解创伤弧菌的分子特征。方法 应用PCR-变形梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对创伤弧菌的16S-23S rDNA间区(16S-23S rDNA intergenic spacer regions,ISR)多态性进行分析比较,结合药敏试验,以进一步验证分离菌株之间的亲缘关系。结果 ISR-PCR将创伤弧菌菌株扩增出4条约900、750、650、550bp大小不同的...
16S rRNA基因序列分析法鉴定病原细菌
16SrRNA 病原细菌 基因序列分析
2013/11/11
运用16S rRNA 基因序列分析法鉴定14种细菌,为该方法的临床应用奠定基础。方法: 提取细菌DNA,采用通用引物PCR扩增16S rRNA 基因片段并测序。将测序结果用Blastn 在线软件在Nucleotide 数据库中进行序列同源性比对,根据序列同源性鉴定病原细菌。结果: 12种细菌可以鉴定到“种”,2种细菌可以鉴定到“属”。 结论: 16S rRNA 基因序列分析是一种有效的病原细菌鉴定...
Hydrogen bonds are related to the thermal stability of 16S rRNA
Optimal Growth Temperature 16S Ribosomal RNA G + C Content Hydrogen Bonds Base Pairs Nucleotide Compositions
2013/1/28
The number of base pairs in the 16S rRNA secondary structures of 51 bacterial sequences was counted, and the number of hydrogen bonds was estimated. The number of hydrogen bonds was highly correlated ...
浦东机场口岸蝇类携带病原菌种类及16S rRNA鉴定
蝇类 病原菌 16S rRNA 鉴定
2014/6/18
确定口岸蝇类携带病原菌种类及分布。方法 将蝇类体表、体内细菌分离培养, 单克隆菌株经Vitek 2 Compact微生物自动分析及16S rRNA基因序列比对。结果 在7种蝇体表检出18种菌, 其中致病菌2种, 条件致病菌14种, 包括1株国内未报道的条件致病菌株Wohlfahrtiimonas chitiniclastica;蝇体内检出14种菌, 其中致病菌1种, 条件致病菌12种;携带菌种类最...
利用线粒体16S rRNA基因全序列分析直翅目主要类群的系统发生关系
直翅目 16SrRNA 系统发生
2013/7/23
为了构建稳健的直翅目主要类群间的系统发生关系并探讨16S rRNA基因序列在构建直翅目昆虫不同分类阶元系统发生关系时的可行性、功效以及性能, 文章测定了直翅目4总科9科18种昆虫的16S rRNA基因全序列, 联合已知该基因全序列的其他40种昆虫, 构建了直翅目主要类群之间的系统发生关系, 并分析了16S rRNA基因全序列的系统发生性能和功效。结果表明, 直翅目昆虫的16S rRNA基因全长平均...
用地衣红-卡红染色进行共生菌的形态观察,鉴定棘阿米巴CB/S1内共生细菌。克隆内共生细菌的16S rDNA基因,进行基因序列分析。结果表明,经地衣红-卡红染色棘阿米巴CB/S1内共生细菌呈黑色和棒状,在胞质内不规则分布。棘阿米巴CB/S1内共生细菌的16S rDNA基因长1 534 bp,与类亚洲嗜阿米巴杆菌(Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2)和韩国棘阿米...
Method for rapid identification of oral streptococci by PCR using 16S-23S ribosomal RNA intergenic spacer gene
16S-23S rRNA intergenic spacer gene Oral streptococci PCR Species identification
2008/4/16
Mutans group streptococci play an important role in the formation of dental caries, while mitis group streptococci are considered to be associated with subacute bacterial endocarditis. Both mitis and ...
肝癌组织中螺杆菌16S rRNA基因的检测
2007/7/28
专著信息
书名
肝癌组织中螺杆菌16S rRNA基因的检测
语种
中文
撰写或编译
撰写
作者
黄燕,范学工,陈永平,李宁,汤立军
第一作者单位
出版社
世界华人消化杂志,2002;10(8):877-882
出版地
出版日期
2002年
月
日
标准书号
介质类型
纸质
页数
字数
开本
相关项目
人肝组织螺杆菌的鉴定及其肝细胞毒作用的研究