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中国科学院昆明动物研究所专利：猪12号染色体上与窝产仔数相关的SNP位点。
中国科学院昆明动物研究所专利：一种德克塞尔羊SNP标记及其筛选方法和应用。
中国科学院昆明动物研究所专利：一种杜泊羊SNP标记及其筛选方法和应用
中国科学院昆明动物研究所 专利 杜泊羊 SNP标记 筛选方法
2024/6/28
中国科学院昆明动物研究所专利：一种杜泊羊SNP标记及其筛选方法和应用。
本发明公开了一种葡萄抗寒性相关的SNP分子标记及其应用,通过前期筛选得到抗寒性强的葡萄品种和抗寒性弱的葡萄品种之间具有显著表达差异的VvCML基因，在VvCML基因上挖掘得到了具有显著差异的SNP位点，突变位点为148bpC/T的突变。本发明通过鉴定VvCML基因序列与葡萄抗寒性的关系，开发了与抗寒性相关的SNP分子标记，并进一步进行四引物法直接PCR分型，实现对葡萄幼苗直接而快速的遗传鉴定，可对...
本发明中公开了一种马尾松高产脂功能SNP标记的筛选方法及其应用。该方法包括如下步骤：采集无性系马尾松的松脂并分别测定其产脂力大小，再从产脂力高、中、低的无性系马尾松样本中收集组织材料，提取RNA后进行PacBio全长转录组测序，同时开展二代转录组、代谢组、蛋白组测序并进行差异表达分析筛选候选基因，以此开发SNP功能标记。本发明方法只需针对少数样品进行转录组等多组学测序，具有较高的SNP位点开发效率...
广东省林业科学研究院专利：一种鉴定肉桂醛型阴香的SNP分子标记及其引物和应用
肉桂醛型阴香 SNP 分子标记 鉴定引物
2024/5/20
本发明属于分子生物的技术领域，具体涉及一种鉴定肉桂醛型阴香的SNP分子标记及其引物和应用。所述SNP分子标记位于基因Cbur03G002680的第6和第7外显子之间的9个位点，包括第11位点、第146位点、第157位点、第176位点、第197位点、第206位点、第236位点、第238位点和第242位点；所述第6和第7外显子之间的基因核酸序列如SEQ ID NO.4所示，所述SNP分子标记用于鉴定肉...
本发明属于分子生物的技术领域，具体涉及一种与阴香植物龙脑含量紧密关联的基因、SNP分子标记及其引物和应用。所述基因编号为Cbur03G002680，其编码序列如SEQ ID NO.1所示。所述SNP分子标记为基因Cbur03G002680的第7个外显子中的第14位点、第16位点和第135位点；所述第7个外显子的核酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述SNP分子标记，为通过筛选阴香Cbur03G0...
中国农业科学院棉花研究所专利：与棉花衣分性状显著相关的基因、SNP标记及其应用
棉花 衣分性状 基因 SNP标记
2024/5/13
本发明涉及棉花衣分性状分子生物学领域，特别涉及与棉花衣分性状显著相关的基因、SNP标记及其应用。与棉花衣分性状显著相关的基因，为基因Gh_D05G1124和/或Gh_D05G0313。本发明以276份陆地棉材料为材料，种植于多个环境中，采用CottonSNP63K基因芯片进行基因分型，共获得10660个高质量的SNPs，用于遗传结构分析和GWAS。结果共发现23个与衣分性状显著相关的SNPs，对应...
本发明属于生物技术领域，公开了中棉所70群体中与棉花纤维强度相关的一个QTL，位于陆地棉24号染色体，定位到6个SNP分子标记，定位到116个基因并对其中一些基因的表达模式进行了分析。本发明还公开了一种与棉花相关的QTL的应用，该QTL和SNP分子标记可用于分子标记辅助选择育种，显著提高强度纤维品系的选择效率，为进一步提高纤维品质提供了一种最经济有效的分子育种新途径。
中国科学院西双版纳热带植物园（以下简称“版纳植物园”）植物系统发育与多样性保护研究组选取黄杞（Engelhardia roxburghiana）为研究物种，利用生物信息学软件STACKS，探索使用不同参考基因组对SNP Calling的影响。该研究围绕两种不同参考基因组：使用近缘种（即枫杨：Pterocarya stenoptera）作为参考基因组，以及利用物种本种（即黄杞）作为参考基...
中国科学院昆明分院不同参考基因组对RAD-seq分析中SNP Calling的影响（图）
基因 分析 群体进化
2024/5/26
随着新一代测序技术兴起，基于酶切的简化基因组测序（Restriction-site associated DNA sequencing，RAD-seq）由于不受参考基因组的限制，成为快速获取生物高密度单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）的主流手段，被广泛运用于变异检测、遗传图谱构建、功能基因挖掘、群体进化分析等研究中。尽管在RAD-seq分析中对S...
随着新一代测序技术兴起，基于酶切的简化基因组测序（Restriction-site associated DNA sequencing，RAD-seq）由于不受参考基因组的限制，成为快速获取生物高密度单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）的主流手段，被广泛运用于变异检测、遗传图谱构建、功能基因挖掘、群体进化分析等研究中。尽管在RAD-seq分析中对S...
中国农业科学院棉花研究所专利：与陆地棉枯萎病抗病相关的SNP分子标记及其应用
陆地棉 枯萎病 抗病性 SNP分子标记
2024/4/15
本发明公开了与陆地棉枯萎病抗病相关的SNP分子标记及其应用。本发明首先公开了检测棉花基因组中SNP标记的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测棉花对枯萎病抗性中的应用；所述SNP标记为位于棉花基因组D03号染色体第2259240位核苷酸，其核苷酸种类为A和C。本发明进一步公开了鉴定或辅助鉴定待测棉花对枯萎病抗性的方法。本发明所提供的SNP标记可用于棉花枯萎病抗病性的早期预测，还可以用于棉花遗传背...
本发明公开了与陆地棉D08染色体纤维强度相关主效QTL紧密连锁的SNP位点及应用，该陆地棉纤维强度主效QTL位点qFS D08 1、qFS D08 2和qFS D08 3均位于染色体D08上，LOD值在10.299和13.774之间，可解释13.917％ 17.148％的表型变异。本发明所述的SNP分子标记是以陆地棉稳定的RIL群体为材料，通过简化基因组测序(GBS)的方法得到。本发明所公开的这些...
中国农业科学院棉花研究所专利：与陆地棉叶片绒毛相关的SNP分子标记及其应用
陆地棉 叶片绒毛 SNP分子标记
2024/4/11
本发明提供与陆地棉叶片绒毛相关的SNP分子标记及其应用，属于分子生物学领域。本发明与陆地棉植株绒毛相关的SNP标记共31个，这些标记具有SEQ ID No.1～SEQ ID No.31所示的DNA序列，这些SNP分子标记单独或任两个或多个组合应用均可用于陆地棉植株绒毛的早期预测，还可用于棉花遗传背景分析和筛选，以及植株绒毛位点分子标记辅助选择育种，具有广阔的应用前景。